No decorrer dos anos, a FFM estabeleceu parcerias, em conjunto com o Sistema Acadêmico FMUSP-HC, com as mais diversas instituições voltadas ao desenvolvimento das ciências médicas, como Ministérios, Secretarias Estaduais e Municipais, agências de fomento à pesquisa, hospitais, indústrias farmacêuticas, empresas da iniciativa privada, instituições internacionais, universidades etc. O maior resultado dessas parcerias é o fortalecimento da assistência integral à saúde desenvolvida pelo Sistema em seus diversos institutos e unidades, assegurando à população a continuidade dos atendimentos médico-hospitalares pelo SUS.

Conheça abaixo as atuais instituições parceiras da FFM:

Órgãos Públicos Federais:

• Agência Nacional de Vigilância Sanitária – ANVISA; 
• Ministério da Ciência e Tecnologia / CNPq; 
• Ministério da Ciência e Tecnologia / Finep; 
• Ministério da Saúde – MS; 
• Ministério Público do Trabalho / Procuradoria do Trabalho do Município de Patos de Minas;
• Organização Pan Americana de Saúde – OPAS / Organização Mundial da Saúde (por meio do Ministério da Saúde); 
• Petróleo Brasileiro S/A – Petrobrás (Sociedade de economia mista); 
• Procuradoria Geral da Fazenda Nacional.

Órgãos Públicos Estaduais:

• Conselho Regional de Fisioterapia e Terapia Ocupacional da 3ª Região - CREFITO; 
• Instituto de Infectologia Emílio Ribas; 
• Secretaria de Estado da Saúde de São Paulo – SES-SP.
  

Instituições Privadas Nacionais:

• Agência Brasileira de Desenvolvimento Industrial – ABDI; 
• Aids Healthcare Foundation do Brasil; 
• Associação Beneficente Síria – Hospital do Coração; 
• Associação UMANE; 
• Banco Industrial do Brasil S.A.;
• Braincare Desenvolvimento e Inovação Tecnológica S.A.; 
• Brainfarma Indústria Química e Farmacêutica S.A.; 
• Central Nacional Unimed – Cooperativa Central;
  
• CISCO Comércio e Serviços de Hardware e Software do Brasil Ltda; 
• DM Healthcare Tecnologia em Saúde Ltda.;
• Fundação Butantan; 
• Fundação Maria Cecília Souto Vidigal;
• GE Healthcare do Brasil;
• Grupo Itaú;
• Instituto Butantan;
• Instituto de Ensino e Pesquisa – Insper;
• Instituto de Responsabilidade Social Sírio-Libanês;
• Instituto Mahle;
• Instituto Todos Pela Saúde; 
• Magazine Luiza S.A.; 
• Natura Cosméticos S/A;
• Sanofi Aventis Farmacêutica Ltda.; 
• Siemens Healthcare Diagnósticos Ltda.;

Instituições Internacionais:

• Abbott Laboratories; 
• AIGORA GMBH;
• Alzheimer’s Association; 
• Americas Hepato – Pancreato - Biliary Association Foundation - AHPBA Foundation; 
• Baxter Healthcare Corporation;
• Baylor College of Medicine;
• Baylor University
• Banco Interamericano de Desenvolvimento – BID; 
• Bill and Melinda Gates Foundation; 
• bioMérieux S.A.; 
• Companhia dos Temperos Ltda. (Portugal);
  
• Diomics Corporation; 
• Drexel University;
• Family Health International; 
• Fellows of Harvard College; 
• Fondation Mérieux; 
• Fred Hutchinson CancerCenter;
• Fundación Infant (Argentina);
• Global Disability Innovation Hub C.I.C.;
• Grand Challenges Canada; 
• Grinberg Laboratory – University of California San Francisco;
  
• H. Lee Moffitt Cancer Center and Research Institute, Inc.;
  
• Harvard Graduate School of Education;  
• Hebrew Rehabilitation Center; 
• Icahn School of Medicine at Mount Sinai; 
• Imperial College of Science, Technology and Medicine; 
• International Atomic Energy Agency – IAEA;
• International Brain Research Organization;
• J. David Gladstone Institutes; 
• Jhpiego Corporation; 
• Joan & Sanford I. Weill Medical College of Cornell University; 
• Johns Hopkins International Injury Research Unit;
• Johns Hopkins University;
• Kephera Diagnostics;
• Lead Discovery Center GmbH;
• Lego Foundation;
• London School of Hygiene & Tropical Medicine; 
• Milken Institute; 
• Ministério do Ensino Superior, Ciência, Tecnologia e Inovação da República de Angola;
• Natera, Inc.;
  
• National Institutes of Health – NIH; 
• Network for Investigation of Delirium;
• Novartis Institutes for BioMedical Researchs, Inc.;
• Optina Diagnostics, Inc.;
• Partners Healthcare (founded by Brigham and Women’s Hospital and Massachusetts General Hospital);
• Regeneron Pharmaceuticals, Inc.;
• Revive & Restore Genetic Rescue of Endangered and Extinct Species;
• Swiss Tropical and Public Health Institute;
• The Board of Trustees of the University of Alabama for the University of Alabama at Birmingham;
  
• The George Washington University;  
• The Ohio State University;
• The Regents of the University of California – Berkeley; 
• The Regents of the University of California, São Francisco;
  
• The Smile Train; 
• The Trustees of Columbia University of New York;
  
• The United Nations Office for Project Services;
  
• The University of Birmingham;
  
• The University of California, San Diego;
  
• The University of Kentucky Research Foundation;
  
• The University of North Caroline at Chapel Hill; 
• Thomas Jefferson University; 
• United Nations Children's Fund – UNICEF;
• Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf – UKE;
• University Health Network; 
• University of Newcastle Upon Tyne;
• Vanderbilt University Medical Center; 
• ViiV Healthcare UK Ltd.; 
• Vital Strategies, Inc.; 
• Vitalant Research Institute;
• Wellcome Trust;
• William Marsh Rice University;
• World Health Organization; 
• Yale University.